如何通过chembl下载所研究靶点的活性小分子集

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Chembl数据库是欧洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute,EBI)开发的一个在线的免费的活性小分子数据库,它通过从大量文献中收集各种靶点及化合物的生物活性数据,为科学家们提供了一个非常便利的信息查询平台。目前,该数据库共收集了1.2万个靶点,180.0万个化合物,共有110万条生物活性信息。通过该数据库,用户可以快速查询到某个靶点目前已报道的化合物及其活性信息,也可以查询某个化合物在哪些靶点做过的生物活性测试及其数据。这些数据都来源于各种已报道的文献,数据较为可靠,且能够溯源,查询到数据的出处。通过该数据库,用户可以节省大量查阅文献和收集化合物数据的时间,快速获取准确的化合物及其生物学数据,进一步加速药物设计和药物开发的速度。如何通过chembl下载所研究靶点的活性小分子集呢?

工具/原料

  • chembl数据库
  • 所研究靶点的英文名称

方法/步骤

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    进入chembl数据库,在搜索框输入所研究靶点的英文名称,例如DPP4,随后点击“Target”;

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    搜索结果出现该靶点的各种种属及其复合物,大家根据自己的研究需求勾选,例如只想研究人源种属的靶点,就只选择人源的。勾选后,点击“please select”下拉框,选择“Display Bioactivities”

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    随后出来6306个生物活性信息,点击“please select”下拉框,选择“download All Bioactivity Data (XLS)”,即可下载人源DPP4的活性小分子集,所下载文件用excel打开即可

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