用Past软件做主成分分析(PCA)

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主成分分析(PCA)是排序分析(Ordination)的一种,常用于生态学领域。本文介绍如何用Past做主成分分析

工具/原料

  • Past软件

方法/步骤

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    Past数据导入及样品分组方法见百度经验《Past统计分析软件数据导入及分组方法》,最终得到如图所示的数据形式。

    首先Ctrl+A全选数据

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    Multivariate菜单--Ordination--Principle Components (PCA)

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    Summary选项卡列出了每个坐标轴的Eigenvalue值及其所占百分比。

    如果修改了运行参数,需要点击Recompute重新计算

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    Scatter Plot选项卡给出了PCA图,右边有若干选项(例如是否显示样品标签)

    点击“Graph Setting”按钮可设置更多作图选项

    用Past软件做主成分分析(PCA)
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    如图可增加图片的外边框,将坐标轴由中间位置改为在边框上。

    可选择多种图片格式(SVG是矢量图,最清晰),点击Picture按钮可保存图片。

    用Past软件做主成分分析(PCA)
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    Scores选项卡显示样品点在PCA图上的坐标,点击Copy复制全部内容,可粘贴到excel中。

    用Past软件做主成分分析(PCA)
    END
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    此文章未经许可获取自百度经验

注意事项

  • 本经验适用于Past 3.x,低版本Past的操作界面略有不同
经验内容仅供参考,如果您需解决具体问题(尤其法律、医学等领域),建议您详细咨询相关领域专业人士。
作者声明:本篇经验系本人依照真实经历原创,未经许可,谢绝转载。
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